外科手术优点是立杆见影，可以利用短时间来解决囊肿对肾脏造成的压迫，同时清除的部分囊液可以有效减少内源性因子，使局部缺血得到改善，恢复部分肾功能，缺点是造成肾脏二次损伤，一般每次的囊肿去顶个数大小数目平均约４５０-６００个左右，同时可以出现胸膜损伤，腹膜损伤，肾静脉或其分支损伤，等后遗症，外科手术有利有弊，如果患者要选择手术来解决当前病状的话首先要先了解手术的方法，过去一直沿用去顶减压术，去顶减压术虽然比较传统，但是效果还是比较安全有效，随着近几年的医学科研发展，各地相继开展了穿刺，去顶减压联合内引流。穿刺注射药物等方法，经过我多年来对行手术的患者进行的随访调查研究、对比总结。多囊肾手术治疗还是以单纯的去顶减压手术效果好，单纯的去顶减压手术是将单个较大的囊肿顶部用术剪剪掉囊肿顶部，使其囊肿内液体排除，减轻囊肿对肾脏的压迫来保护肾脏功能，其预后效果还是比较理想，一般术后可起到5年左右的作用，在术后几年配合内科治疗血肌酐控制在300以下，女性优于男性。
但是随着近几年医学研究发展，开展的其他类多囊肾手术预后效果比较，从理论来讲十分完美，将囊壁用电刀戳开，使其囊肿与囊肿相通，然后将囊液引流到肾盂内，从构想理论方面来讲似乎比较科学，石家庄肾病医院多囊肾专家根据多位曾行术治疗的患者反映，调查对比研究发现，内引流不仅不能解决患者症状，而且会在短时期内使肾脏功能积聚下降，而且肾脏容易造成膨胀形成球状，患者术后的肌酐尿酸等会快速上升而且无法恢复到原来化验值，内引流患者一般1年后就要进行血液透稀才能维持生命。
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